Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALX1Q15699 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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