Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TAF11Q15544 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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TAF11Q15544 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TAF11Q15544 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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