Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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