Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC3Q15034 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC3Q15034 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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