Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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