Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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