Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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GTF2H2Q13888 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF2H2Q13888 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF2H2Q13888 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GTF2H2Q13888 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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