Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms