Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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