Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FHL3Q13643 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms