Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms