Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPM6BQ13491 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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