Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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