Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCOF1Q13428 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCOF1Q13428 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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