Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AP3B2Q13367 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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