Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP1Q13363 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms