Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRSQ13332 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRSQ13332 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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