Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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