Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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