Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms