Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms