Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms