Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms