Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms