Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms