Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms