Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms