Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms