Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms