Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms