Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms