Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN1Q04323 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms