Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms