Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms