Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIBQ01892 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms