Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms