Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms