Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms