Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms