Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms