Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms