Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ELF3P78545 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ELF3P78545 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ELF3P78545 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms