Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2NP61088 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms