Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ATP5EP56381 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms