Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B3P54709 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms