Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX2P50458 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms