Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX1P48742 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX1P48742 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX1P48742 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX1P48742 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LHX1P48742 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms