Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOX2P48431 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOX2P48431 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms