Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms