Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV4P43268 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV4P43268 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV4P43268 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ETV4P43268 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms